Discuz! Board

 找回密码
 立即注册
搜索
热搜: 活动 交友 discuz
查看: 36|回复: 0

总结几点关于PCR仪的应用经验,附保养注意事项

[复制链接]

1万

主题

1万

帖子

5万

积分

管理员

Rank: 9Rank: 9Rank: 9

积分
58026
发表于 2020-9-27 08:05:33 | 显示全部楼层 |阅读模式

                    

                    

                    
                    
                    <section data-role="outer" label="Powered by gulangu"><section><p><p><img src="image/20200927/c3b9c399831f50ead73d74f32d73592d_1.png" /></p></p><p><p><img src="image/20200927/01a3a819a4ee58f43ff8414001dc0c04_2.png" /></p></p><p><br  /></p></section><p><span>简单的说,PCR就是利用DNA聚合酶对特定基因做体外或试管内In Vitro的大量合成,基本上它是利用DNA聚合酶进行专一性的连锁复制。</span></p><p><br  /></p><p><span>目前,常用的技术,可以将一段基因复制为原来的一百亿至一千亿倍。根据DNA扩增的目的和检测的标准,可以将PCR仪分为普通PCR仪,梯度PCR仪,原位PCR仪,实时荧光定量PCR仪四类。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="90940"><section data-width="100%"><section><section><section><p><img src="image/20200927/7353acf6044094d361edadfdd3431714_3.png" /></p></section></section><section data-brushtype="text"><strong>PCR产物的电泳检测时间</strong></section><section><section><p><img src="image/20200927/4f15c04c40158e65e132df7aaea9718b_4.png" /></p></section></section></section></section></section><p><br  /></p><p><span>一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚至消失。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="90940"><section data-width="100%"><section><section><section><p><img src="image/20200927/7353acf6044094d361edadfdd3431714_3.png" /></p></section></section><section data-brushtype="text"><strong>PCR反应的关键环节</strong></section><section><section><p><img src="image/20200927/4f15c04c40158e65e132df7aaea9718b_4.png" /></p></section></section></section></section></section><p><br  /></p><p><span>①板核酸的制备</span></p><p><br  /></p><p><span>②引物的质量与特异性</span></p><p><br  /></p><p><span>③酶的质量</span></p><p><br  /></p><p><span>④PCR循环条件,寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="90150"><section><section data-width="100%"><p data-brushtype="text">酶切分析</p></section></section></section><p><br  /></p><p><span>根据PCR产物中限制性内切酶的位点,用相应的酶切、电泳分离后,获得符合理论的片段,此法既能进行产物的鉴定,又能对靶基因分型,还能进行变异性研究。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="90150"><section><section data-width="100%"><p data-brushtype="text">分子杂交</p></section></section></section><p><br  /></p><p><span>分子杂交是检测PCR产物特异性的有力证据,也是检测PCR产物碱基突变的有效方法。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="90150"><section><section data-width="100%"><p data-brushtype="text">Southern印迹杂交</p></section></section></section><p><br  /></p><p><span>在两引物之间另合成一条寡核苷酸链(内部寡核苷酸)标记后做探针,与PCR产物杂交。此法既可作特异性鉴定,又可以提高检测PCR产物的灵敏度,还可知其分子量及条带形状,主要用于科研。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="90150"><section><section data-width="100%"><p data-brushtype="text">斑点杂交</p></section></section></section><p><br  /></p><p><span>将PCR产物点在硝酸纤维素膜或尼膜薄膜上,再用内部寡核苷酸探针杂交,观察有无着色斑点,主要用于PCR产物特异性鉴定及变异分析。</span></p><p><br  /></p><p><span>氯仿抽提掉蛋白质和其它细胞组份,用乙醇或异丙醇沉淀核酸。提取的核酸即可作为模板用于PCR反应。</span></p><p><br  /></p><p><span>一般临床检测标本,可采用快速简便的方法溶解细胞,裂解病原体,消化除去染色体的蛋白质使靶基因游离,直接用于PCR扩增。</span></p><p><br  /></p><p><span>RNA模板提取一般采用异硫氰酸胍或蛋白酶K法,要防止R-Nase降解RNA。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="90150"><section><section data-width="100%"><p data-brushtype="text">温度与时间的设置</p></section></section></section><p><br  /></p><p><span>基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点。</span></p><p><br  /></p><p><span>在标准反应中采用三温度点法,双链DNA在90~95℃变性,再迅速冷却至40~60℃,引物退火并结合到靶序列上,然后快速升温至70~75℃,在Taq DNA聚合酶的作用下,使引物链沿模板延伸。</span></p><p><br  /></p><p><span>对于较短靶基因(长度为100~300bp时)可采用二温度点法,除变性温度外、退火与延伸温度可合二为一,一般采用94℃变性,65℃左右退火与延伸(此温度Taq DNA酶仍有较高的催化活性)。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="88354"><section><section><p><img src="image/20200927/117f4d64ca1e88af6b028359674aef71_7.gif" /></p></section></section></section><p><br  /></p><p><strong><span>实验操作注意事项:</span></strong></p><p><br  /></p><p><span>尽管扩增序列的残留污染大部分是假阳性反应的原因,样品间的交叉污染也是原因之一。因此,不仅要在进行扩增反应是谨慎认真,在样品的收集、抽提和扩增的所有环节都应该注意:</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="" aria-describedby="tooltip792471">1</section></section></section></section></section></section><p><span>戴一次性手套,若不小心溅上反应液,立即更换手套;</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="">2</section></section></section></section></section></section><p><span>使用一次性吸头,严禁与PCR产物分析室的吸头混用,吸头不要长时间暴露于空气中,避免气溶胶的污染;</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="" aria-describedby="tooltip452635">3</section></section></section></section></section></section><p><span>避免反应液飞溅,打开反应管时为避免此种情况,开盖前稍离心收集液体于管底。若不小心溅到手套或桌面上,应立刻更换手套并用稀酸擦拭桌面;</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="" aria-describedby="tooltip90594">4</section></section></section></section></section></section><p><span>操作多份样品时,制备反应混合液,先将dNTP、缓冲液、引物和酶混合好,然后分装,这样即可以减少操作,避免污染,又可以增加反应的精确度;</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="">5</section></section></section></section></section></section><p><span>最后加入反应模板,加入后盖紧反应管;</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="">6</section></section></section></section></section></section><p><span>操作时设立阴阳性对照和空白对照,即可验证PCR反应的可靠性,又可以协助判断扩增系统的可信性;</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="">7</section></section></section></section></section></section><p><span>尽可能用可替换或可高压处理的加样器,由于加样器最容易受产物气溶胶或标本DNA的污染,最好使用可替换或高压处理的加样器。</span></p><p><br  /></p><p><span>如没有这种特殊的加样器,至少PCR操作过程中加样器应该专用,不能交叉使用,尤其是PCR产物分析所用加样器不能拿到其它两个区;</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="" aria-describedby="tooltip958502">8</section></section></section></section></section></section><p><span>重复实验,验证结果,慎下结论。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="88354"><section><section><p><img src="image/20200927/117f4d64ca1e88af6b028359674aef71_7.gif" /></p></section></section></section><p><br  /></p><p><strong><span>在仪器的维护保养中,需要注意以下问题:</span></strong></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="" aria-describedby="tooltip119801">1</section></section></section></section></section></section><p><span>PCR仪器需要定期检测,视制冷方式而定一般半年至少一次。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="" aria-describedby="tooltip510832">2</section></section></section></section></section></section><p><span>PCR反应的要求温度与实际分布的反应温度是不一致的,当检测发现各孔平均温度差偏离设置温度大于1~2℃时,可以运用温度修正法纠正PCR实际反应温度差。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="" aria-describedby="tooltip754343">3</section></section></section></section></section></section><p><span>PCR反应过程的关键是升、降温过程的时间控制,要求越短越好,当PCR仪的降温过程超过60s,就应该检查仪器的制冷系统,对风冷制冷的PCR仪要较彻底地清理反应底座的灰尘;对其他制冷系统应检查相关的制冷部件。</span></p><p><br  /></p><section data-tools="gulangu" data-id="91563"><section data-role="paragraph"><section><section data-width="100%"><section><section data-brushtype="text" data-original-title="" title="" aria-describedby="tooltip939419">4</section></section></section></section></section></section><p><span>一般情况如能采用温度修正法纠正仪器的温度时,不要轻易打开或调整仪器的电子控制部件,必要时要请专业人员修理或利用仪器电子线路详细图纸进行维修。</span></p><section><p><br  /></p><p><span><strong><span>【版权声明】:</span><span>本文由整理发布,资料源自修社,版权归原作者所有,转载请注明来源!</span></strong><br  /><br  /></span></p><section><p><img src="image/20200927/200097153c0fd6c4a2af471bc6042bc0_9.jpg" /></p><span><strong>微信ID:yxiubang</strong></span></section><section><span><strong><p><img src="image/20200927/0a8607a88b19f6a44d0b44de3db914af_10.jpg" /></p>长按左侧二维码关注</strong></span></section><p><br  /></p><p><br  /></p></section></section><p><br  /></p>
               
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

Archiver|手机版|小黑屋|Comsenz Inc. ( 浙ICP备17000336号-1 )

GMT+8, 2025-3-13 17:28 , Processed in 0.078975 second(s), 33 queries .

Powered by Discuz! X3.4

© 2001-2017 Comsenz Inc.

快速回复 返回顶部 返回列表