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荧光PCR/实时定量PCR技术应用简介

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发表于 2020-10-21 13:25:44 | 显示全部楼层 |阅读模式

                    

                    

                    
                    
                    <p><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">一.荧光PCR原理 </span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">1.荧光共振能量传递 (FRET)</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">某荧光标记基团在激发光刺激下生成某波长的发射光,当另一屏蔽基团与其距离合适时,原发射光将会被屏蔽基团所吸收,并转化为其他波长的发射光或热能,称之为FRET。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">2.荧光化学:</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5’-3’外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">二.实时荧光PCR技术靶基因的确定及引物和探针的设计原则</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">1.靶基因的确定:选择检测组共有的基因以避免检测的假阴性(漏检)。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">2.检测片段的确定:选择检测组内的保守 (突变少)(避免假阴性)、组间特异的序列 (突变多)(避免假阳性)作为引物探针的设计位置。片段长度70-150bp。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">3.引物:长度17-25bp;GC含量30-80%;退火温度(Tm值)58-60℃;避免稳定的引物二聚体(特别是多联检测)及发夹结构(自由能大于-3.5kc/m);序列不能出现连续的G,3’端避免G或C,最后5个碱基内避免两个以上的G或C。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">4.探针:长度20-30bp(Taqman)或16-25bp(MGB);GC含量30-80%;Tm值为68-70℃;避免稳定的二聚体及发夹结构 (自由能大于-3.5kc/m);5’端不能是G;位置尽量靠近上游引物;选择波长差异较大(多联检测)或Fam(单联检测)的荧光标记。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">三.特点和优势</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">1.特异性强:引物和探针的“双保险”,避免检测的假阳性。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">2.灵敏度高:分析PCR产物的对数期,自动化仪器收集荧光信号,避免了许多人为因素干扰。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">3.避免污染:全封闭反应,无须PCR后处理。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">4.实现定量:运用标准品获得标准曲线,结合Ct值进行准确定量。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">5.高效低耗:可实现一管多检。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">6.操作简便:在线式实时监测扩增结果,不必接触有害物质。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">7.快速:反应时间&lt;1.5小时。</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">四.实用意义:</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">1.提高检测效率,缩短检测周期,提高通关速度;</span><br style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px; white-space: normal; background-color: rgb(255, 255, 255);"  /><span style="color: rgb(51, 51, 51); font-family: 宋体; font-size: 14px; line-height: 25px;  background-color: rgb(255, 255, 255);">2.降低检测成本,提高经济与社会效益。</span></p><hr style="white-space: normal;"  /><p style="white-space: normal; text-align: center; line-height: 1.75em;"><strong style="font-size: 14px; line-height: 21px; color: rgb(255, 255, 255); font-family: arial, helvetica, sans-serif; margin: 0px; padding: 0px; max-width: 100%; box-sizing: border-box !important; word-wrap: break-word !important;"><span class="bkcolor" style="margin: 0px 8px 0px 0px; padding: 4px 10px; max-width: 100%; border-top-left-radius: 5px; border-top-right-radius: 5px; border-bottom-left-radius: 5px; border-bottom-right-radius: 5px; background-color: rgb(191, 0, 0); box-sizing: border-box !important; word-wrap: break-word !important;"></span></strong><br  /></p><p style="white-space: normal; text-align: center; line-height: 1.75em;"><strong><span style="line-height: 2em; color: rgb(255, 0, 0);">ID: </span></strong></p><p style="white-space: normal; text-align: center; line-height: 1.75em;"><span style="font-size: 14px;">最具人气的医疗器械维修新媒体平台</span></p><p style="white-space: normal; text-align: center; line-height: 1.75em;"><span style="font-size: 11px;"><span style="font-size: 14px;">分享医疗器械前沿动态、医疗器械维修经验</span>        </span></p><p style="white-space: normal; text-align: center; line-height: 1.75em;"><span style="font-size: 14px;">医疗器械维修人自己的交流平台</span></p><p style="white-space: normal; text-align: center; line-height: 1.75em;"><strong><span style="color: rgb(127, 127, 127); font-size: 11px;">加群主微信 </span></strong><strong><span style="color: rgb(149, 55, 52); font-size: 11px;">shanying916</span></strong><strong><span style="color: rgb(127, 127, 127);"><span style="font-size: 11px;"><span style="color: rgb(149, 55, 52); font-size: 11px;"></span> </span><span style="font-size: 12px;">与更多行业从业人员互动交流</span></span></strong><strong style="line-height: 1.75em; font-size: 16px;"><span style="color: rgb(127, 127, 127); font-size: 12px;">            </span></strong></p><p style="white-space: normal; line-height: 1.75em; text-align: center;"><strong><span style="color: rgb(127, 127, 127);"><span style="font-size: 12px;"><img data-s="300,640" data-type="jpeg" src="http://mmbiz.qpic.cn/mmbiz/A1DicCH9Vl6MoypciaNOibiaxmVLk8eA6ibKL14uWjKsZwrWboQYKTfXqPicXycwL1icfia1pAG0VzlTX3MRR4FPV0ZtZA/0" data-ratio="1.0136054421768708" data-w="147"  /></span></span></strong></p>
               
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